Zeig doch mal ein paar Infos oder zahlen. Was stehen im Gutachten für Netto und Brutto-Werte. Was wurde an Stunden angesetzt und zu welchem Preis?
Wie Versicherung zahlt bei fiktiver Abrechnung IMMER nur den Netto-Betrag aus (also ohne MwSt.). Wahrscheinlich wird dir auch noch der BMW-Stundensatz gekürzt worden sein, weil bei fiktiver Abrechnung ein ortsüblicher Satz verwendet wird und nicht der einer Vertragswerkstatt.
Wenn also am Gutachten 2000 EUR Brutto standen, solltest du "normalerweise" ~1680 EUR bekommen. Du hast doch bestimmt ein Schreiben bekommen, das detailliert drinsteht.
Du kannst die Rechnung aber tatsächlich noch einreichen und bekommst die dafür angefallene MwSt. erstattet. Wie es sich allerdings verhält, dass der Rechnungsbetrag unter dem der fiktiven Abrechnung ist, weiß ich nicht.