Es kann helfen, kann aber entweder zu spät sein oder eben nicht an den Dichtungen liegen.
Versuchs dennoch mal mit dem Fett. Die Richtung aus dem das Geräusch kommt kann stark täuschen. Vor allem drücken die Bolzen ja alles nochmal etwas auf Spannung.
Bei meinem E93 hats kurz mal geklappert, bei starken Bodenwellen bzw Schlaglöchern verzeih ich ihm das auch, aber ansonsten klappert bei mir nichts. Ich pflege meine Dichtungen alle 3-4 Monate.
Die Seitenscheiben einzustellen ist kein Spaß. Das würd ich machen lassen, auch wenns teuer werden wird. Da würd ich dann aber eher in eine gute freie Werkstatt fahren.