Also wenn Dein Motor lauter ist als vorher, kann das durchaus vom abgerissenen Flexrohr herrühren. Ich hatte dadurch auch ein Dröhngeräusch, weil das nachfolgende Auspuffrohr entsprechend locker hing.
Zur Start-Stop: Ich hab sie eh immer aus, fördert nur den Verschleiß an Deinem Wagen. Es gibt einige Parameter, welche die Funktion ausser Kraft setzen - z.B. Klimaanlage an, Aussentemperatur niedrig/hoch, Batteriespannung zu schwach, Frontscheibe beschlagen, Kühlwassertemperatur zu niederig... Ein voller DPF denke ich, hat hier keine Auswirkung, höchstens die Regenerationsphase des DPF könnte darauf Einfluss haben.