Hallo.
Nach einer längeren Fahrt (nicht Kurzstrecke) fasse mal deine Felgen an, sie müssen achsweise ungefähr gleich warm sein. Dadurch kannst du festsitzende Bremse ausschließen, diese würde auch Vibrationen verursachen. Wenn ein Reifen einen Höhenschlag hat, müsste das Problem sich mit höheren Geschwindigkeiten verschlimmern, das findest du raus wenn du Reifen von vorne nach hinten wechselst.
PS: Was verdächtig ist, dass das Problem weg ist, wenn du Kupplung tritts. Das hört sich so an als ob die Kardanwelle gelöst war, und nicht in die gleiche Position geschraubt wurde bzw. hat durch andere Position etwas Unwucht.
Gruß.