Die junctionbox ist das Gateway, also das Steuergerät welches die Kommunikation unter den verschiedenen Bussystemen ermöglicht.
Bevor du die jbe blind ersetzt, solltest du das andere erstmal ausschließen.
Den PT-Can da messen wo du dran kommst. Beide Leitungen aber parallel darstellen, dann kannst du Unterschiede erkennen. Ein Bus mit 500 k/Bit hat einen (spannungs) Ausschlag von 1 Volt.